Modelización basada en agentes: canibalismo microbiano

作者: Marta Ginovart , Albert Tutusaus , M. Teresa Mas

DOI: 10.4995/MSEL.2019.10975

关键词:

摘要: En un sistema biologico, las interacciones entre los organismos pueden ser interespecificas, cuando se relacionan de la comunidad diferente especie, o intraespecificas. Estas interacciones, que favorables, desfavorables indiferentes para el crecimiento, supervivencia, y/o reproduccion organismos, determinar area distribucion y situacion territorial tener papel esencial en evolucion temporal poblaciones. Amensalismo, comensalismo, depredacion, mutualismo, parasitismo, competencia canibalismo son diferentes tipos interacciones. establecerse a lo largo del tiempo espacio, siendo normalmente su ambito actuacion local por proximidad contacto directo. Se considerar como propias especies comportamientos probables, dar no, segun sean condiciones ambientales encuentren organismos. Todo esto hace modelizacion matematica mas tradicional sufra muchas limitaciones este contexto, tanto tratamiento discontinuidades espacio tiempo, adaptaciones cambios repentinos sufrir respuesta diversos factores puedan ver expuestos. El enfoque perspectiva modelos computacionales basados agentes (ABM) puede considerarse interesante representacion estas proposito trabajo es mostrar investigar tratar con biologicas traves ABM. primer lugar presentan algunos ejemplos ABM implementados entorno programacion acceso abierto disponible desde web, plataforma multiagente NetLogo. A continuacion, escogida una interaccion intraespecifica particular, microbiano exhibe bacteria Bacillus subtilis, presenta caso estudio, desarrollo diseno conceptual representacion, implementacion NetLogo, analisis sensibilidad unifactorial alguno sus parametros explorar virtual bajo distintos escenarios simulacion. simulador obtenido sera manejado academico (su origen fue Trabajo Final Grado titulacion Ingenieria Sistemas Biologicos Universitat Politecnica Catalunya), util docencia realizacion investigaciones vinculadas microbianas, abriendo expectativas futuras aplicaciones practicas.

参考文章(31)
Marta Ginovart, Xavier Portell, Mónica Blanco, Pol Ferrer-Closas, Modelos basados en el individuo y la plataforma NetLogo Unión. Revista Iberoamericana de educación matemática. ,vol. 27, pp. 131- 150 ,(2011)
Thomas Banitz, Anna Gras, Marta Ginovart, Individual-based modeling of soil organic matter in NetLogo: Transparent, user-friendly, and open Environmental Modelling & Software. ,vol. 71, pp. 39- 45 ,(2015) , 10.1016/J.ENVSOFT.2015.05.007
Marta Ginovart Gisbert, Monica Blanco, Xavier Portell, Pol Ferrer-Closas, Modelización basada en el individuo: una metodología atractiva para el estudio de biosistemas. Enseñanza de las Ciencias. Revista de investigación y experiencias didácticas. ,vol. 30, pp. 93- 108 ,(2012) , 10.5565/REV/EC/V30N2.572
Marta Ginovart Gisbert, Qué pueden ofrecer los modelos basados en agentes vivos en el contexto docente Modelling in Science Education and Learning. ,vol. 8, pp. 5- 26 ,(2015) , 10.4995/MSEL.2015.3486
Virginie Molle, Masaya Fujita, Shane T. Jensen, Patrick Eichenberger, José E. González-Pastor, Jun S. Liu, Richard Losick, The Spo0A regulon of Bacillus subtilis. Molecular Microbiology. ,vol. 50, pp. 1683- 1701 ,(2003) , 10.1046/J.1365-2958.2003.03818.X
Individual-Based Models and Approaches in Ecology Journal of Animal Ecology. ,vol. 63, pp. 496- ,(1992) , 10.1007/978-1-4757-0869-1
Ferdi L. Hellweger, Vanni Bucci, A bunch of tiny individuals—Individual-based modeling for microbes Ecological Modelling. ,vol. 220, pp. 8- 22 ,(2009) , 10.1016/J.ECOLMODEL.2008.09.004
Janusz Uchmański, Volker Grimm, Individual-based modelling in ecology: what makes the difference? Trends in Ecology and Evolution. ,vol. 11, pp. 437- 441 ,(1996) , 10.1016/0169-5347(96)20091-6