Diversity of the marine picocyanobacteria Prochlorococcus and Synechococcus assessed by terminal restriction fragment length polymorphisms of 16S-23S rRNA internal transcribed spacer sequences

摘要: Con el fin de evaluar la utilizacion secuencias del espaciador interno transcrito (ITS) en estudios genetica poblacion cianobacterias marinas, se amplifico y clono secuencia gen ARNr 16S junto a region espadadora 16S-23S seis cepas Prochlorococcus Synechococcus. Se analizaron los amplicones ITS por electroforesis gel gradiente desnaturalizacion (DGGE) polimorfismos longitud fragmentos restriccion terminal (T-RFLP). Al aplicar metodos estandares estas tecnicas, obtuvo mas una banda o fragmento (T-RF) cepa clonada. Informes literatura han sugerido que anomalias podrian ser atribuidas formacion estructuras secundarias. Por consiguiente, estructura secundaria las Synechococcus fue modelada diferentes temperaturas utilizaron durante reaccion cadena polimerasa (PCR). Dicho modelamiento predijo existencia bucles persistir incluso temperatura extension. Es probable estos generen productos PCR con incompletos hebras simples. En este trabajo modifico procedimiento metodo T-RFLP anadiendo partidor marcado ultimos dos ciclos. Esto resulto, para mayoria casos, obtencion un solo ribotipo. La aplicacion esta tecnica muestra medio ambiente obtenida frente al norte Chile, demostro es posible identificar presencia, determinar abundancia relativa, varios linajes filogeneticos generos habitan zona eufotica. El analisis filogenetico obtenidos clonacion secuenciacion ADN partir misma confirmo presencia genotipos. modificacion propuesta, debiera adecuado estudio diversidad poblaciones naturales cianobacterias, pudiendo transformarse importante herramienta estudiar factores influyen organismos.