Diversification dans le genre Malus

摘要: Malgre son importance economique, culturelle et historique, l’histoire evolutive du pommier cultive (Malus domestica) ainsi que celle de ses apparentes sauvages supposes, restaient encore tres peu connues. En s’appuyant sur les nouvelles approches genetique des populations (approximate Bayesian computation) avec l’utilisation marqueurs microsatellites sequences nucleaires, cette these a eu pour objectif d’etudier, differentes echelles evolutives (phylogeographie, speciation, domestication), mecanismes diversification naturelle artificielle dans le genre Malus. Mes travaux ont porte quatre especes pommiers distribuees travers l’Eurasie orientalis (Caucase), Malus sieversii (Asie Centrale), sylvestris (Europe), baccata (Siberie)) la seule espece domestiquee genre, domestica. Cette s’est articulee en parties visant respectivement inferer : (i) domestication depuis centre d’origine Asie Centrale, (ii) recolonisation post-glaciaire sauvage Europeen (M. sylvestris), (iii) histoires speciation entre cinq Malus, (iv) hybridations interspecifiques capacites dispersion trois principaux contributeurs sylvestris, M. orientalis) au genome cultive. L’etude montre processus sont originaux chez cet arbre fruitier, par l'absence goulet d’etranglement l’existence d’introgressions post-domestication frequentes une autre sylvestris) l’espece ancestrale sieversii). structure populations) revelent grandes tailles populations, forts flux genes faibles structures genetiques spatiales chacune especes. aussi revele taux d’hybridations interspecifiques, particulier fortes introgressions Europe Centrale. etude permis l'amelioration connaissances structuration ayant contribue l’etendue sauvages. Ces revetent grande autant conservation sauvages, maintien leur integrite habitats fragmentes varietale domestique.