Caracterización Genética y Funcional de la Proteína ns P1a/4 de Astrovirus Humano

作者: Cristina Fuentes Pardo

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摘要: Los astrovirus humanos son virus de gastroenteritis infantiles y tienen un genoma RNA monocatenario polaridad positiva organizado en tres pautas abiertas lectura (ORF1a ORF1b para las proteinas no estructurales, ORF2 estructurales). Actualmente se desconoce la funcion muchas sus estructurales. No obstante, region C-terminal poliproteina nsP1a codificada por el ORF1a (denominada nsP1a/4) han descrito multitud motivos que podrian tener una biologica relevante su ciclo replicativo. Entre otros, cabe destacar presencia hipervariable (HVR), ha relacionado con posible papel replicacion del virico, putativa codificante proteina VPg. Bajo estas premisas los objetivos esta tesis fueron profundizar caracterizacion nsP1a/4 tanto a nivel variabilidad genetica como funcional confirmar experimentalmente existencia VPg unida covalentemente al virico. El analisis HVR mostro grado elevado variabilidad, sobre todo aminoacidos, buena tolerancia inserciones deleciones cambios sinonimos. Por otro lado, filogenetico 104 aislados permitio identificacion 12 genotipos diferentes carga virica excretada muestras clinicas correspondientes distintos derivados correlacion significativa entre estos dos parametros. Aprovechando astrovirus, desarrollo tambien metodo tipado molecular amplificacion RT-PCR polimorfismo longitud fragmentos restriccion (RFLP). Con fin establecer posibles diferencias funcionales genotipos, clonaron expresaron sistema baculovirus varias formas IV, V, VI XII. Asi, todos estudiados, observo existen isoformas proteina, isoforma fosforilada fosforiladas, fosforiladas interaccionan si formando oligomeros. Ademas, dada implicacion proceso RNA, estudio potencial interaccion polimerasa virica. Para interacciona heterodimero. En cuanto forma polimerasa, resultados mostraron lo hacen fosforilada, bien este caso observaron genotipos. Concretamente, correspondiente genotipo presento patron mas fuerte comparacion fosforilada. VPg, co-purificadas revelo peso (13-15 kDa) compatible predicha computacionalmente. La peptido 15 aminoacidos confirmo localiza dentro tratamiento proteolitico Proteinasa K demostro dicha resulta esencial infectividad virus. Finalmente, uso distintas mutadas identificar residuo Tyr693 union RNA. Asi pues, mejor proporciona bases aplicacion futuro nuevas dianas antiviricas.

参考文章(147)
Sarah Daijogo, Bert L. Semler, Mechanistic Intersections Between Picornavirus Translation and RNA Replication Advances in Virus Research. ,vol. 80, pp. 1- 24 ,(2011) , 10.1016/B978-0-12-385987-7.00001-4
Ernesto Méndez, Andrea Murillo, Rodrigo Velázquez, Andrew Burnham, Carlos F. Arias, Replication Cycle of Astroviruses Springer New York. pp. 19- 45 ,(2012) , 10.1007/978-1-4614-4735-1_2
O. P. Sehgal, V. Veerisetty, Proteinase K-sensitive factor essential for the infectivity of southern bean mosaic virus ribonucleic acid. Phytopathology. ,vol. 70, pp. 282- 284 ,(1980)
Ewa Sadowy, Małgarzata Miłner, Anne-Lise Haenni, Proteins attached to viral genomes are multifunctional. Advances in Virus Research. ,vol. 57, pp. 185- 262 ,(2001) , 10.1016/S0065-3527(01)57004-9
Flavio Meggio, Arianna Donella Deana, Maria Ruzzene, Anna M. Brunati, Luca Cesaro, Barbara Guerra, Thomas Meyer, Helmut Mett, Doriano Fabbro, Pascal Furet, Grazyna Dobrowolska, Lorenzo A. Pinna, Different susceptibility of protein kinases to staurosporine inhibition Kinetic studies and molecular bases for the resistance of protein kinase CK2 FEBS Journal. ,vol. 234, pp. 317- 322 ,(1995) , 10.1111/J.1432-1033.1995.317_C.X
V. R. Racaniello, Picornaviridae : the viruses and their replication Fields virology. ,(2001)
S S Monroe, S E Stine, L Gorelkin, J E Herrmann, N R Blacklow, R I Glass, Temporal synthesis of proteins and RNAs during human astrovirus infection of cultured cells. Journal of Virology. ,vol. 65, pp. 641- 648 ,(1991) , 10.1128/JVI.65.2.641-648.1991
Tatsuya Tamaoki, Hisayo Nomoto, Isami Takahashi, Yuzuru Kato, Makoto Morimoto, Fusao Tomita, Staurosporine, a potent inhibitor of phospholipid/Ca++dependent protein kinase. Biochemical and Biophysical Research Communications. ,vol. 135, pp. 397- 402 ,(1986) , 10.1016/0006-291X(86)90008-2