Variations dans les réseaux de régulation chez une levure œnologique et impacts sur les propriétés fermentaires

作者: Christian Brion

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摘要: Les souches Saccharomyces cerevisiae presentent une forte diversite phenotypique, notamment au niveau des proprietes fermentaires parmi les œnologiques. bases moleculaires de ces differences comportements ainsi que mecanismes d'adaptation a l'environnement œnologique sont encore mal connues. variations d'expression genique contribuent cette cependant reseaux et genes concernes peu decrits. Afin d'aborder questions, nous avons developpe approche integree « genetique-genomique » qui combine la cartographie QTL en fermentation alcoolique profils d'une population recombinee. La recherche permis detecter 1465 eQTL correspondant regulations locales ou distantes dont certaines regroupees hotspots. Nous determine qu'une duplication d'un segment chromosomique est impliquee dans le controle cinetique fermentation. Nos donnees ont revele perturbations concernent nombreux metaboliques. caracterise plus finement sources affectent systemes detoxification, montre modifications regulation plusieurs exporteurs membranaires liees mutations facteurs transcription. egalement decrypte controlant du metabolisme thiamine. montrons alteration senseur Thi3p, conduit privilegier l'expression biosynthese thiamine chez souche aux depens gene pyruvate decarboxylase. Ces travaux d'acceder partie responsables l'adaptation conditions

参考文章(199)
Robert Gentleman, Vincent J Carey, Wolfgang Huber, Rafael A Irizarry, Sandrine Dudoit, Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and Bioconductor ,(2006)
Barbara Dunn, R Paul Levine, Gavin Sherlock, Microarray karyotyping of commercial wine yeast strains reveals shared, as well as unique, genomic signatures BMC Genomics. ,vol. 6, pp. 53- 53 ,(2005) , 10.1186/1471-2164-6-53
G. K. Smyth, limma: Linear Models for Microarray Data Springer, New York, NY. pp. 397- 420 ,(2005) , 10.1007/0-387-29362-0_23
Yona Kassir, Noam Adir, Elisabeth Boger-Nadjar, Noga Guttmann Raviv, Ifat Rubin-Bejerano, Shira Sagee, Galit Shenhar, Transcriptional regulation of meiosis in budding yeast. International Review of Cytology-a Survey of Cell Biology. ,vol. 224, pp. 111- 171 ,(2003) , 10.1016/S0074-7696(05)24004-4
Kazuto Nosaka, Mari Onozuka, Hiroyuki Konno, Yuko Kawasaki, Hiroshi Nishimura, Mamoru Sano, Kenichi Akaji, Genetic regulation mediated by thiamin pyrophosphate-binding motif in Saccharomyces cerevisiae Molecular Microbiology. ,vol. 58, pp. 467- 479 ,(2005) , 10.1111/J.1365-2958.2005.04835.X
Jean-Marie Sablayrolles, Jean-Louis Roustan, Anne Julien, Laurent Dulau, Comparison of nitrogen and oxygen demands of enological yeasts : Technological consequences American Journal of Enology and Viticulture. ,vol. 51, pp. 215- 222 ,(2000)
Ulrich Güldener, Susanne Heck, Thomas Fiedler, Jens Beinhauer, Johannes H Hegemann, A New Efficient Gene Disruption Cassette for Repeated Use in Budding Yeast Nucleic Acids Research. ,vol. 24, pp. 2519- 2524 ,(1996) , 10.1093/NAR/24.13.2519
Zhao-Bang Zeng, Precision mapping of quantitative trait loci. Genetics. ,vol. 136, pp. 1457- 1468 ,(1994) , 10.1093/GENETICS/136.4.1457
J H McCusker, D A Stevens, R W Davis, K V Clemons, Genetic Characterization of Pathogenic Saccharomyces Cerevisiae Isolates Genetics. ,vol. 136, pp. 1261- 1269 ,(1994) , 10.1093/GENETICS/136.4.1261