Quantification de la méthylation de l'adn

作者: Nickolas Papadopoulos , Sanford Markowitz , Meng Li , Kenneth W. Kinzler , Luis Diaz

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摘要: Cette invention concerne l'utilisation de la methylation anormale l'ADN comme biomarqueur chez les patients atteints d'un cancer. Il est important determiner avec precision fraction des molecules methylees dans un echantillon etudie, cette determination precise pouvant etre effectuee par technique methyl-BEAMing (beads, emulsion, amplification, magnetics). Des d'ADN traitees au bisulfate peuvent amplifiees PCR sein nano-compartiments aqueux contenant billes, ce qui permet d'obtenir une population billes chacune milliers copies molecule matricielle. Apres hybridation sondes specifiques sequences methylees, analysees cytometrie en flux. approche capable detecter et denombrer methylee d'environ 5 000 non methylees. La quantification d'evenements rares generalement applicable a l'etude genes methyles echantillons cliniques.

参考文章(4)
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Frank Diehl, Meng Li, Yiping He, Kenneth W Kinzler, Bert Vogelstein, Devin Dressman, BEAMing: single-molecule PCR on microparticles in water-in-oil emulsions Nature Methods. ,vol. 3, pp. 551- 559 ,(2006) , 10.1038/NMETH898
Meng Li, Wei-dong Chen, Nickolas Papadopoulos, Steven N Goodman, Niels Christian Bjerregaard, Søren Laurberg, Bernard Levin, Hartmut Juhl, Nadir Arber, Helen Moinova, Kris Durkee, Kerstin Schmidt, Yiping He, Frank Diehl, Victor E Velculescu, Shibin Zhou, Luis A Diaz, Kenneth W Kinzler, Sanford D Markowitz, Bert Vogelstein, Sensitive digital quantification of DNA methylation in clinical samples Nature Biotechnology. ,vol. 27, pp. 858- 863 ,(2009) , 10.1038/NBT.1559
Wei-Dong Chen, Z. James Han, Joel Skoletsky, Jeff Olson, Jerome Sah, Lois Myeroff, Petra Platzer, Shilong Lu, Dawn Dawson, Joseph Willis, Theresa P. Pretlow, James Lutterbaugh, Lakshmi Kasturi, James K. V. Willson, J. Sunil Rao, Anthony Shuber, Sanford D. Markowitz, Detection in Fecal DNA of Colon Cancer–Specific Methylation of the Nonexpressed Vimentin Gene Journal of the National Cancer Institute. ,vol. 97, pp. 1124- 1132 ,(2005) , 10.1093/JNCI/DJI204