Estudi genètic integral de la regió 4p15 i identificació de PI4K2B i STIM2 com a gens alterats en càncer colorectal

作者: Álvaro Aytés Meneses

DOI:

关键词: BiologyHumanities

摘要: DE LA TESI:El diagrama complet de les pertorbacions genetiques i epigenetiques que afecten el cancer colorectal (CCR) esta lluny ser totalment conegut. L'LOH es una alteracions mes recurrents en CCR aixi com d'altres neoplasies. Acostuma a un bon indicador la presencia gens rellevants per carcinogenesi. L'estudi somatiques situats aquestes regions desequilibri al·lelic ha estat fonamental passat identificacio d'alguns dels supressors tumorals coneguts, cas p53, Smad4, p16, APC o Rb. Els desequilibris al·lelics 4p s'han associat amb major agressivitat pitjor pronostic pacients CCR, malgrat els diana d'aquests resten encara identificats. En aquesta tesi s'ha dut terme treball d'analisi genetica integral regio critica situada 4p15 am intencio localitzar-hi probablement estiguin contribuint progressio tumoral. Hem realitzat exhaustiu d'al·lotipat mitjancant utilitzacio marcadors microsatel·lit, sobre model tumors xenoempeltats ratolins atimics. identificat al candidats han analitzats d'acord seves possibles i/o epigenetiques. Tambe hem analitzat patrons d'expressio tal d'identificar transcripcionals. Mitjancant prediccions regulacio transcripcional bioinformatiques trobat PI4K2B STIM2 son dos regulats TCF4/B-catenina. Aixo confirmat immunoprecipitacio cromatines. avaluat valor aquests seu predictors resposta tractament basat 5-FU CCR. A mes, experiments deplecio mitjancada siRNA linies cel·lulars alhora transfectat forma estable gens. Finalment assajos formacio immunodeprimits comprovar si sobreexpressio nostres te no efecte generats partir cel·lulars. LOH identificats descarten que, s'havia proposat, doni l'estadi metastatic acumulacio d'aquestes alteracions. detectat correlaciona dosi genica, dir perdues d'heterozigositat comporten perdua material genetic consequencia processos recombinacio mitotica duplicacio associats escenari d'inestabilitat cromosomica. d'aquesta portadors mutacions, microdelecions ni delecions homozigosi, tampoc presenten metilacio promotores. Per contra, vam trobar estaven significativament sobreexpressats afectes metastasi hepatiques (MH) independentment d'LOH, seva transcripcio estava sot control del complex nivells elevats PI4K2B, tant proteina d'mRNA estan assocats millor quimioterapic Finalment, estudis demostrat silenciament comporta increment significatiu proliferacio cel·lular resulta disminucio volum tumoral supressio proliferacio. Conclusions: dianes via B-catenina. La supressor cel·lular, alhora, impacte colorectal.

参考文章(47)
Giuseppe Barbanti-Brodano, Silvia Sabbioni, Carlo M. Croce, Massimo Negrini, GOK: a gene at 11p15 involved in rhabdomyosarcoma and rhabdoid tumor development. Cancer Research. ,vol. 57, pp. 4493- 4497 ,(1997)
Thomas Ried, Torsten Liersch, Heinz Becker, B. Michael Ghadimi, Marian Grade, Molecular cytogenetics: genomic imbalances in colorectal cancer and their clinical impact. Analytical Cellular Pathology. ,vol. 28, pp. 71- 84 ,(2006) , 10.1155/2006/173815
Sara Milchgrub, John D. Minna, Adi F. Gazdar, Arvind K. Virmani, Narayan Shivapurkar, Anirban Maitra, Sanjay Sood, Ignacio I. Wistuba, Multiple regions of chromosome 4 demonstrating allelic losses in breast carcinomas. Cancer Research. ,vol. 59, pp. 3576- 3580 ,(1999)
Amedeo Cappione, Gary Skuse, B. French, A potential role for NF1 mRNA editing in the pathogenesis of NF1 tumors American Journal of Human Genetics. ,vol. 60, pp. 305- 312 ,(1997)
Bernard Dutrillaux, Michèle Gerbault-Seureau, Yorgos Remvikos, Brigitte Zafrani, Marguerite Prieur, Breast cancer genetic evolution: I. Data from cytogenetics and DNA content. Breast Cancer Research and Treatment. ,vol. 19, pp. 245- 255 ,(1991) , 10.1007/BF01961161
S. Sabbioni, A. Veronese, M. Trubia, R. Taramelli, G. Barbanti-Brodano, C.M. Croce, M. Negrini, Exon structure and promoter identification of STIM1 (alias GOK), a human gene causing growth arrest of the human tumor cell lines G401 and RD. Cytogenetic and Genome Research. ,vol. 86, pp. 214- 218 ,(1999) , 10.1159/000015341
Jen Liou, Man Lyang Kim, Won Do Heo, Joshua T. Jones, Jason W. Myers, James E. Ferrell, Tobias Meyer, STIM Is a Ca2+ Sensor Essential for Ca2+-Store-Depletion-Triggered Ca2+ Influx Current Biology. ,vol. 15, pp. 1235- 1241 ,(2005) , 10.1016/J.CUB.2005.05.055
Chieu B. Diep, Kristine Kleivi, Franclim R. Ribeiro, Manuel R. Teixeira, Ole C. Lindgjaerde, Ragnhild A. Lothe, The order of genetic events associated with colorectal cancer progression inferred from meta-analysis of copy number changes Genes, Chromosomes and Cancer. ,vol. 45, pp. 31- 41 ,(2006) , 10.1002/GCC.20261
G. T. Deans, T. G. Parks, B. J. Rowlands, R. A. J. Spence, Prognostic factors in colorectal cancer British Journal of Surgery. ,vol. 79, pp. 608- 613 ,(2005) , 10.1002/BJS.1800790706
Zhe Piao, Chanil Park, Jeon-Han Park, Hoguen Kim, Deletion mapping of chromosome 4q in hepatocellular carcinoma International Journal of Cancer. ,vol. 79, pp. 356- 360 ,(1998) , 10.1002/(SICI)1097-0215(19980821)79:4<356::AID-IJC8>3.0.CO;2-U