Le transcriptome : un domaine d'application pour les statistiques, de nouveaux horizons pour la biologie

摘要: Les mesures des niveaux d'expression d'un génome entier requièrent une analyse statistique afin d'obtenir des conclusions fiables. Les biologistes ont du mal à se retrouver dans la foule de méthodes existantes et les comparaisons actuellement employées reposent sur des critères lacunaires ou non biologiques. L'organisation du génome bactérien permet la définition d'un critère de comparaison à pertinence biologique indépendante de la problématique : les opérons. Une comparaison de méthodes classiques grâce à ce critère a été appliquée sur des méthodes classiques. Par ailleurs les méta-analyses de transcriptome sont en train de se développer malgré les biais inhérents à cette technologie. Elles ouvrent la possibilité d'étudier de nouveaux champs en biologie comme l'organisation chromosomique de l'expression des gènes. L'étude de trois bactéries, B. subtilis, E. coli et S. meliloti a révélé des corrélations d'expression à longue distance (environ 600kb) quel que soit le gène étudié.