Protein interaction maps for model organisms

Sergey Zozulya, Mario Lioubin, Ronald J. Hill, Clare Abram, Mikhail L. Gishizky, Mapping signal transduction pathways by phage display Nature Biotechnology. ,vol. 17, pp. 1193- 1198 ,(1999) , 10.1038/70736

Edward M. Marcotte, Matteo Pellegrini, Michael J. Thompson, Todd O. Yeates, David Eisenberg, A combined algorithm for genome-wide prediction of protein function Nature. ,vol. 402, pp. 83- 86 ,(1999) , 10.1038/47048

Philippe Brottier, Francis Quétier, William Saurin, Jean Weissenbach, Hugues Roest Crollius, Olivier Jaillon, Alain Bernot, Corinne Dasilva, Laurence Bouneau, Cécile Fischer, Cécile Fizames, Patrick Wincker, Estimate of human gene number provided by genome-wide analysis using Tetraodon nigroviridis DNA sequence Nature Genetics. ,vol. 25, pp. 235- 238 ,(2000) , 10.1038/76118

John R. Yates, Mass spectrometry. From genomics to proteomics. Trends in Genetics. ,vol. 16, pp. 5- 8 ,(2000) , 10.1016/S0168-9525(99)01879-X

Gert Jansen, Karen L Thijssen, Pia Werner, Marieke van derHorst, Esther Hazendonk, Ronald H A Plasterk, The complete family of genes encoding G proteins of Caenorhabditis elegans Nature Genetics. ,vol. 21, pp. 414- 419 ,(1999) , 10.1038/7753

Albertha J.M. Walhout, Gary F. Temple, Michael A. Brasch, James L. Hartley, Monique A. Lorson, Sander van den Heuvel, Marc Vidal, GATEWAY recombinational cloning: application to the cloning of large numbers of open reading frames or ORFeomes. Methods in Enzymology. ,vol. 328, pp. 575- 592 ,(2000) , 10.1016/S0076-6879(00)28419-X

A. Goffeau, R. Aert, M. L. Agostini-Carbone, K. Holmstrøm, O. Horaitis, T. S. Horsnell, M.-E. Huang, B. Hughes, S. Hunicke-Smith, S. Hunt, S. E. Hunt, K. Huse, R. W. Hyman, F. Iborra, K. J. Indge, I. Iraqui Houssaini, K. Isono, C. Jacq, M. Jacquet, A. Jacquier, K. Jagels, W. Jäger, C. M. James, J. C. Jauniaux, Y. Jia, M. Jier, A. Jimenez, D. Johnson, L. Johnston, M. Johnston, M. Jones, J.-L. Jonniaux, D. B. Kaback, T. Kallesøe, S. Kalman, A. Kalogeropoulos, L. Karpfinger-Hartl, D. Kashkari, C. Katsoulou, A. Kayser, A. Kelly, T. Keng, H. Keuchel, P. Kiesau, L. Kirchrath, J. Kirsten, K. Kleine, U. Kleinhans, R. Klima, C. Komp, E. Kordes, S. Korol, P. Kötter, C. Krämer, B. Kramer, P. Kreisl, T. Kucaba, H. Kuester, O. Kurdi, P. Laamanen, M. J. Lafuente, O. Landt, G. Lanfranchi, Y. Langston, D. Lashkari, P. Latreille, G. Lauquin, T. Le, P. Legrain, Y. Legros, A. Lepingle, H. Lesveque, H. Leuther, H. Lew, C. Lewis, Z. Y. Li, S. Liebl, A. Lin, D. Lin, M. Logghe, A. J. E. Lohan, E. J. Louis, G. Lucchini, K. Lutzenkirchen, R. Lyck, G. Lye, A. C. Maarse, M. J. Maat, C. Macri, A. Madania, M. Maftahi, A. Maia e Silva, E. Maillier, L. Mallet, G. Mannhaupt, V. Manus, R. Marathe, C. Marck, A. Marconi, E. Mardis, E. Martegani, R. Martin, A. Mathieu, C. T. C. Maurer, M. J. Mazón, C. Mazzoni, D. McConnell, S. McDonald, R. A. McKee, A. D. K. McReynolds, P. Melchioretto, S. Menezes, F. Messenguy, H. W. Mewes, G. Michaux, N. Miller, O. Minenkova, T. Miosga, S. Mirtipati, S. Möller-Rieker, D. Möstl, F. Molemans, A. Monnet, A-L. Monnier, M. A. Montague, M. Moro, D. Mosedale, D. Möstl, S. Moule, L. Mouser, Y. Murakami, F. Del Rey, J. Demolder, N. Démolis, K. Devlin, P. de Wergifosse, F. S. Dietrich, H. Ding, C. Dion, T. Dipaolo, F. Doignon, C. Doira, H. Domdey, J. Dover, Z. Du, E. Dubois, B. Dujon, M. Duncan, P. Durand, A. Düsterhöft, S. Düsterhus, T. Eki, M. El Bakkoury, L. G. Eide, K.-D. Entian, P. Eraso, D. Erdmann, H. Erfle, V. Escribano, M. Esteban, L. Fabiani, F. Fabre, C. Fairhead, B. Fartmann, A. Favello, G. Faye, H. Feldmann, L. Fernandes, F. Feroli, M. Feuermann, T. Fiedler, W. Fiers, U. N. Fleig, M. Flöth, G. M. Fobo, N. Fortin, F. Foury, M. C. Francingues-Gaillard, L. Franco, A. Fraser, J.D. Friesen, C. Fritz, L. Frontali, H. Fukuhara, L. Fulton, L. J. Fuller, C. Gabel, C. Gaillardin, L. Gaillon, F. Galibert, F. Galisson, P. Galland, F.-J. Gamo, C. Gancedo, J. M. Garcia-Cantalejo, M. I. García-Gonzalez, J. J. Garcia-Ramirez, M. García-Saéz, H. Gassenhuber, M. Gatius, S. Gattung, C. Geisel, M. E. Gent, S. Gentles, M. Ghazvini, D. Gigot, V. Gilliquet, N. Glansdorff, A. Gómez-Peris, A. Gonzaléz, S. E. Goulding, C. Granotier, T. Greco, M. Grenson, P. Grisanti, L. A. Grivell, D. Grothues, U. Gueldener, P. Guerreiro, E. Guzman, M. Haasemann, B. Habbig, H. Hagiwara, J. Hall, K. Hallsworth, N. Hamlin, N. J. Hand, V. Hanemann, J. Hani, T. Hankeln, M. Hansen, D. Harris, D. E. Harris, G. Hartzell, D. Hatat, U. Hattenhorst, J. Hawkins, U. Hebling, J. Hegemann, C. Hein, A. Hennemann, K. Hennessy, C. J. Herbert, K. Hernandez, Y. Hernando, E. Herrero, K. Heumann, D. Heuss- Neitzel, N. Hewitt, R. Hiesel, H. Hilbert, F. Hilger, L. Hillier, C. Ho, J. Hoenicka, B. Hofmann, J. Hoheisel, S. Hohmann, C. P. Hollenberg, S. Müller-Auer, J. Mulligan, L. Murphy, M. Muzi Falconi, M. Naitou, K. Nakahara, A. Namath, F. Nasr, L. Navas, A. Nawrocki, J. Nelson, U. Nentwich, P. Netter, R. Neu, C. S. Newlon, M. Nhan, J.-M. Nicaud, R. K. Niedenthal, C. Nombela, D. Noone, R. Norgren, B. Nußbaumer, B. Obermaier, C. Odell, P. Öfner, C. Oh, K. Oliver, S. G. Oliver, B. F. Ouellette, M. Ozawa, V. Paces, C. Pallier, D. Pandolfo, L. Panzeri, S. Paoluzi, A. G. Parle-Mcdermott, S. Pascolo, N. Patricio, A. Pauley, L. Paulin, B. M. Pearson, D. Pearson, D. Peluso, J. Perea, M. Pérez-Alonso, J. E. Pérez-Ortin, A. Perrin, F. X. Petel, B. Pettersson, F. Pfeiffer, P. Philippsen, A. Piérard, E. Piravandi, R. J. Planta, P. Plevani, O. Poch, B. Poetsch, F. M. Pohl, T. M. Pohl, R. Pöhlmann, R. Poirey, D. Portetelle, F. Portillo, S. Potier, M. Proft, H. Prydz, A. Pujol, B. Purnelle, V. Puzos, M. A. Rajandream, M. Ramezani Rad, S. W. Rasmussen, A. Raynal, S. Rechmann, M. Remacha, J. L. Revuelta, P. Rice, G-F. Richard, P. Richterich, M. Rieger, L. Rifken, L. Riles, T. Rinaldi, M. Rinke, A. B. Roberts, D. Roberts, F. Rodriguez, E. Rodriguez-Belmonte, C. Rodriguez-Pousada, A. M. Rodriguez-Torres, M. Rose, R. Rossau, N. Rowley, T. Rupp, M. Ruzzi, W. Saeger, J. E. Saiz, M. Saliola, D. Salom, H. P. Saluz, M. Sánchez-Perez, M. A. Santos, E. Sanz, J. E. Sanz, A.-M. Saren, F. Sartorello, M. Sasanuma, S-I. Sasanuma, T. Scarcez, I. Schaaf-Gerstenschläger, B. Schäfer, M. Schäfer, M. Scharfe, B. Scherens, N. Schroff, M. Sen-Gupta, T. Shibata, T. Schmidheini, E. R. Schmidt, C. Schneider, P. Scholler, S. Schramm, A. Schreer, M. Schröder, C. Schwager, S. Schwarz, C. Schwarzlose, B. Schweitzer, A. Ahmed, M. Aigle, L. Alberghina, K. Albermann, M. Albers, M. Aldea, D. Alexandraki, G. Aljinovic, E. Allen, J. Alt-Mörbe, B. André, S. Andrews, W. Ansorge, G. Antoine, R. Anwar, A. Aparicio, R. Araujo, J. Arino, F. Arnold, J. Arroyo, E. Aviles, U. Backes, M. C. Baclet, K. Badcock, A. Bahr, V. Baladron, J. P. G. Ballesta, A. T. Bankier, A. Banrevi, M. Bargues, L. Baron, T. Barreiros, B. G. Barrell, C. Barthe, A. B. Barton, A. Baur, A.-M. Bécam, A. Becker, I. Becker, J. Beinhauer, V. Benes, P. Benit, G. Berben, E. Bergantino, P. Bergez, A. Berno, I. Bertani, N. Biteau, A. J. Bjourson, H. Blöcker, C. Blugeon, C. Bohn, E. Boles, P. A. Bolle, M. Bolotin-Fukuhara, R. Bordonné, J. Boskovic, P. Bossier, D. Botstein, G. Bou, S. Bowman, J. Boyer, P. Brandt, T. Brandt, M. Brendel, T. Brennan, R. Brinkman, A. Brown, A. J. P. Brown, D. Brown, M. Brückner, C. V. Bruschi, J. M. Buhler, M. J. Buitrago, F. Bussereau, H. Bussey, A. Camasses, C. Carcano, G. Carignani, J. Carpenter, A. Casamayor, C. Casas, L. Castagnoli, H. Cederberg, E. Cerdan, N. Chalwatzis, R. Chanet, E. Chen, G. Chéret, J. M. Cherry, T. Chillingworth, C. Christiansen, J.-C. Chuat, E. Chung, C. Churcher, C. M. Churcher, M. W. Clark, M. L. Clemente, A. Coblenz, M. Coglievina, E. Coissac, L. Colleaux, R. Connor, R. Contreras, J. Cooper, T. Copsey, F. Coster, R. Coster, J. Couch, M. Crouzet, C. Cziepluch, B. Daignan-Fornier, F. Dal Paro, D. V. Dang, M. D’Angelo, C. J. Davies, K. Davis, R. W. Davis, A. De Antoni, S. Dear, K. Dedman, E. Defoor, M. De Haan, Th. Delaveau, S. Del Bino, M. Delgado, H. Delius, D. Delneri, M. Schweizer, A-M. Sdicu, P. Sehl, C. Sensen, J. G. Sgouros, T. Shogren, L. Shore, Y. Shu, J. Skala, J. Skelton, P. P. Slonimski, P. H. M. Smit, V. Smith, H. Soares, E. Soeda, A. Soler-Mira, F. Sor, N. Soriano, J. L. Souciet, C. Soustelle, R. Spiegelberg, L. I. Stateva, H. Y. Steensma, J. Stegemann, S. Steiner, L. Stellyes, F. Sterky, R. K. Storms, H. St. Peter, R. Stucka, A. Taich, E. Talla, I. Tarassov, H. Tashiro, P. Taylor, C. Teodoru, H. Tettelin, A. Thierry, G. Thireos, E. Tobiasch, D. Tovan, E. Trevaskis, Y. Tsuchiya, M. Tzermia, M. Uhlen, A. Underwood, M. Unseld, J. H. M. Urbanus, A. Urrestarazu, S. Ushinsky, M. Valens, G. Valle, A. Van Broekhoven, M. Vandenbol, Q. J. M. Van Der Aart, C. G. Van Der Linden, L. Van Dyck, M. Vanoni, J. C. Van Vliet-Reedijk, A. Vassarotti, M. Vaudin, K. Vaughan, P. Verhasselt, I. Vetter, F. Vierendeels, D. Vignati, C. Vilela, S. Vissers, C. Vleck, D. T. Vo, D. H. Vo, M. Voet, G. Volckaert, D. Von Wettstein, H. Voss, P. Vreken, G. Wagner, S. V. Walsh, R. Wambutt, H. Wang, Y. Wang, J. R. Warmington, R. Waterston, M. D. Watson, N. Weber, E. Wedler, H. Wedler, Y. Wei, S. Whitehead, B. L. Wicksteed, S. Wiemann, L. Wilcox, C. Wilson, R. Wilson, A. Winant, E. Winnett, B. Winsor, P. Wipfli, S. Wölfl, P. Wohldman, K. Wolf, K. H. Wolfe, L. F. Wright, H. Wurst, G. Xu, M. Yamasaki, M. A. Yelton, K. Yokohama, A. Yoshikawa, S. Yuping, P. Zaccaria, M. Zagulski, F. K. Zimmermann, J. Zimmermann, M. Zimmermann, W-W. Zhong, A. Zollner, E. Zumstein, The yeast genome directory. Nature. ,vol. 387, pp. 5- 5 ,(1997) , 10.1038/387S005

Feng Liang, Ingeborg Holt, Geo Pertea, Svetlana Karamycheva, Steven L. Salzberg, John Quackenbush, Gene index analysis of the human genome estimates approximately 120,000 genes. Nature Genetics. ,vol. 25, pp. 239- 240 ,(2000) , 10.1038/76126

James R Priess, Thomas Blumenthal, Donald L Riddle, Barbara J Meyer, C. Elegans II ,(1998)

Andrew Fire, SiQun Xu, Mary K. Montgomery, Steven A. Kostas, Samuel E. Driver, Craig C. Mello, Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans Nature. ,vol. 391, pp. 806- 811 ,(1998) , 10.1038/35888