Estudi comparatiu de l'estructura del gen "Adh" a vàries espècies de "Drosophila"

作者: Gemma Marfany i Nadal

DOI:

关键词:

摘要: S'ha caracterizat l'estructura de la regio genomica del gen "Adh" a quatre especies genere "Drosophila", pertanyents al subgrup "obscura": "D. ambigua", subobscura", madeirensis" i guanche" amb els objectius d'analitzar l'organitzacio l'evolucio d'aquesta dins d'aquest clarificar les relacions filogenetiques d'aquestes especies. Per assolir aquestes fites, es van construir llibreries genomiques cada especie que crivellar una sonda contenia el melanogaster", per tal d'aillar sequencies homologues aquest gen. Els clons positius caracteritzar primer restriccio despres sequenciacio. Tambe va analitzar seva localitzacio citogenetica mitjancant hibridacions "in situ" sobre cromosomes politenics. En especies, un copia unica, d'expressio regulada dos promotors diferents, estructura comparable presenta melanogaster": tres exons mida diferent separats petits introns. A mes, sequencia troba molt conservada en totes elles. altra part, immediatament adjacent 3' "Adh", altre gen, l' "Adh-dup", d'estructura tambe inter-especificament, pero particularitat codo terminacio diferents tant, longitud proteina codificada varia. Donada l'elevada similitud tant com entre gens confirma ambdos haurien divergit partir duplicacio d'un ancestral. De comparacions inter-especifiques dedueix no regions evolucionen mateix ritme, ja detecten diferencies significatives taxes divergencia nomes codificants codificants, sino tipus regions. substitucions silencioses son mes frequents reemplacament, corn d'esperar degut constrenyiment funcional. Pero, distribucio reemplacament l'atzar llarg codificant: quan compara qualsevol "obscura" subgrupo "melanogaster", s'acumulen significativament tercer exo, mentre que, forma inversa, comparen "obscura", "Adh-dup" distribueixen l'atzar. Aquests trets dona comparacio d'especies s'empra consideren d'altres radiacions llunyanes i, constituiria tret grup. Resumint, doncs, posicions serien s'hauria vist afectada pels processos produir radiacio grup radiacion "melanogaster". Inversament, reflecteix millor canvis produits propia "Adh-dup". Podria tractar-se d'uns bons marcadors moleculars, informatius corresponents radiacions. S'han aillat caracteritzat addicionals funcional, presenten homologia genoma "D .madeirensis" guanche". Fet concorda resultats, ara deteccio varies localitzacions cromosomiques bandes "Southerns" DNA genomic total, "Adh". Les caracteristiques definitories retrosequencies, anomenades processats, posseeixen introns, han estat perfectament escindits, ni tampoc promotores reconeixibles, canvi, "leader" "trailer". seves tractaria transcrits s'haurien retrotranscrit integrat genoma, posteriorment, sofert proces multiplicacio ha afectat adjacents. s'han detectat retrosequencies genomes Immediatament aillades, s'ha trobat moderadament repetit subobscura" conte repeticio invertida 196 pb intermedia palindroms repeticions directes. Amb dades moleculars obtingudes, intentat guanche"," D. formen triade estretament relacionada, essent dues ultimes properes si, gran codificants. .guanche" sembla esser l'especie esta divergint rapidament fet concordaria geografica restringida, nombre efectiu d'individus petit sofreix colls d'ampolla. ambigua" te posicio poc clara filogenia varia segons emprades, semblaria situar-se aprop europees americanes. relativament, divergir aixo explicaria dificultat determinar poscio filogenetica, estaria distorsionant filogenia.

参考文章(29)
Ana M. González, Mariano Hernández, Andrea Volz, José Pestano, José M. Larruga, Diether Sperlich, Vicente M. Cabrera, Mitochondrial DNA evolution in the obscura species subgroup of Drosophila. Journal of Molecular Evolution. ,vol. 31, pp. 122- 131 ,(1990) , 10.1007/BF02109481
W T Starmer, D T Sullivan, M Menotti-Raymond, Characterization of the Structure and Evolution of the Adh Region of Drosophila Hydei Genetics. ,vol. 127, pp. 355- 366 ,(1991) , 10.1093/GENETICS/127.2.355
J. J. Hern�ndez, Ll. Vilageliu, R. Gonz�lez-Duarte, Functional and biochemical features of alcohol dehydrogenase in four species of the obscura group of Drosophila Genetica. ,vol. 77, pp. 15- 24 ,(1988) , 10.1007/BF00058547
D. A. Goldberg, Isolation and partial characterization of the Drosophila alcohol dehydrogenase gene Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ,vol. 77, pp. 5794- 5798 ,(1980) , 10.1073/PNAS.77.10.5794
Michael Ashburner, Mark Bodmer, Francoise Lemeunier, On the evolutionary relationships of Drosophila melanogaster Developmental Genetics. ,vol. 4, pp. 295- 312 ,(1983) , 10.1002/DVG.1020040407
John Devereux, Paul Haeberli, Oliver Smithies, A comprehensive set of sequence analysis programs for the VAX Nucleic Acids Research. ,vol. 12, pp. 387- 395 ,(1984) , 10.1093/NAR/12.1PART1.387
Adalgisa Caccone, Jeffrey R. Powell, Extreme rates and heterogeneity in insect DNA evolution Journal of Molecular Evolution. ,vol. 30, pp. 273- 280 ,(1990) , 10.1007/BF02099997