Etude du régime alimentaire des carnivores par des techniques moléculaires

摘要: La caracterisation des reseaux trophiques est necessaire pour comprendre le fonctionnement ecosystemes et les mecanismes impliques dans leur stabilite. Il parfois difficile de determiner regimes alimentaires notamment especes discretes difficiles a observer comme grands carnivores. Cependant, ces jouent un role cle dont elles influencent la biodiversite. Ainsi, connaitre regime alimentaire predateurs avec precision essentiel etablir strategies conservation. Diverses methodes basees sur monitoring, l'analyse d'echantillons invasifs ou non ont ete utilisees etudier alimentaires. Elles sont generalement biaisees peu resolutives. Les l'identification fragments d'ADN feces potentiel fournir une meilleure information, cadre d'une approche metabarcoding. s'agit caracteriser simultanement l'ensemble l'ADN present echantillon environnemental, en utilisant Nouvelles Techniques Sequencage. Dans ce cas, amorces universelles necessaires amplifier toutes proies potentielles amplifient egalement du predateur s'il y proximite taxonomique (par exemple mammiferes). Ainsi produits PCR obtenus partir essentiellement composes ne refletent pas alimentaire. L'utilisation d'un oligonucleotide blocage limitant specifiquement l'amplification peut resoudre probleme. Nous avons developpe methode type basee l'utilisation d'amorces vertebres (amplifiant region 12SV5) d'oligonucleotides blocage. Bien que quantitative, cette s'est montree robuste, adaptee l'etude tres large spectre proies, resolutive identifier au niveau genre l'espece. l'avons appliquee chat leopard (Prionailurus bengalensis) qui avere diversifie (mammiferes, oiseaux, amphibiens poissons) deux populations Pakistan etudiees. Avec meme approche, nous demontre realite conflit entre l'homme commun (Panthera pardus) presque exclusivement compose d'animaux domestiques. Enfin, pu proposer actions conservations pertinentes apres avoir montre menacee panthere neiges uncia) principalement d'ongules sauvages.