ササリンドウ (Gentiana scabra) およびエゾリンドウ (G. triflora) のRAPD法およびSCARマーカーによる系統識別
作者： Hiroshi Jomori , Ikuo Nakamura , Nanako Kameya , Yoshihito Takahata
DOI: 10.1270/JSBBR.2.81
关键词:
摘要: 現在園芸用のリンドウの育種に利用されているGentianatrifloraとG. scabraの種内および種間の変異性を明らかにするため, G. scabra4系統, triflora6系統, 両種の交配種3系統およびG. triflora同士の交配種2系統の合計15系統を用いRAPD法により解析した. 用いた36個のプライマーのうち, 8個のプライマーで53の多型を示すバンドが得られ, 種間変異と同様に種内変異が存在していた. 数量化理論III類およびクラスター分析を行った結果, 用いた系統はG. scabraとG. trifloraの2群に分かれた.ただし, scabraの1系統Oz (尾瀬系) のみはG. trifloraのグループに属した. また, 両種の交配系統 (G. scabra×G. triflora) はG. scabraと同じグループに属した. 次に, 両種を識別するためのSCAR (Sequence Characterized Amplified Region) マーカー化を試みた. それぞれの種に最も特異的な多型バンドの塩基配列を決定し, 新たな2組のSCARプライマーをデザインした. これらのプライマーのうちG. trifloraに特異的なものは, 同種および同種内の交配系統8系統のうち6系統で特異断片を増幅し, scabraに特異的なプライマーは, RAPD法で疑問が出ているOzを除きすべての系統で特異断片を安定して増幅した. これらのSCARプライマーについては, さらに多くの系統を調査してその安定性を明らかにする必要があるが, 現在のところある程度種を識別できるマーカーとして利用できると考えられた.
sci-hub.st 参考文章(13)
D Botstein, R W Davis, R L White, M Skolnick, Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics. ,vol. 32, pp. 314- 331 ,(1980)
T. A. Cerny, G. Caetano-Anollés, R. N. Trigiano, T. W. Starman, Molecular phylogeny and DNA amplification fingerprinting of Petunia taxa. Theoretical and Applied Genetics. ,vol. 92, pp. 1009- 1016 ,(1996) , 10.1007/BF00224042
T. Millan, F. Osuna, S. Cobos, A. M. Torres, J. I. Cubero, Using RAPDs to study phylogenetic relationships in Rosa. Theoretical and Applied Genetics. ,vol. 92, pp. 273- 277 ,(1996) , 10.1007/BF00223385
I. Paran, R. W. Michelmore, Development of reliable PCR-based markers linked to downy mildew resistance genes in lettuce Theoretical and Applied Genetics. ,vol. 85, pp. 985- 993 ,(1993) , 10.1007/BF00215038
Yong-Ming Yuan, Philippe Küpfer, Jeff J. Doyle, Infrageneric phylogeny of the genus Gentiana (Gentianaceae) inferred from nucleotide sequences of the internal transcribed spacers (ITS) of nuclear ribosomal DNA American Journal of Botany. ,vol. 83, pp. 641- 652 ,(1996) , 10.1002/J.1537-2197.1996.TB12750.X
Takashi Hosoki, Daisuke Kimura, Ryuichi Hasegawa, Tomomi Nagasako, Kaori Nishimoto, Katsumi Ohta, Mari Sugiyama, Kazuhisa Haruki, Comparative Study of Tree Peony (Paeonia suffruticosa Andr.) Cultivars and Hybrids by Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD) Analysis. Engei Gakkai zasshi. ,vol. 66, pp. 393- 400 ,(1997) , 10.2503/JJSHS.66.393
Stephen L. Dellaporta, Jonathan Wood, James B. Hicks, A plant DNA minipreparation: Version II Plant Molecular Biology Reporter. ,vol. 1, pp. 19- 21 ,(1983) , 10.1007/BF02712670
Joe H. Ward, Hierarchical Grouping to Optimize an Objective Function Journal of the American Statistical Association. ,vol. 58, pp. 236- 244 ,(1963) , 10.1080/01621459.1963.10500845
M. Yamagishi, Detection of section-specific random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in Lilium. Theoretical and Applied Genetics. ,vol. 91, pp. 830- 835 ,(1995) , 10.1007/BF00223888
LUDOVIC GIELLY, PIERRE TABERLET, A phylogeny of the European gentians inferred from chloroplast trnL (UAA) intron sequences Botanical Journal of the Linnean Society. ,vol. 120, pp. 57- 75 ,(1996) , 10.1111/J.1095-8339.1996.TB00480.X