Estimation de la diversité parmi les souches de la collection CNRZ : application de la RAPD à un groupe de lactobacilles

作者: P. Tailliez , P. Quénée , A. Chopin

DOI: 10.1051/LAIT:19961-213

关键词:

摘要: Le role principal de la collection CNRZ bacteries lactiques a ete jusqu'a present conserver les souches qui y sont deposees. Outre tests classiques necessaires l'identification, caracterisation ces dernieres reste sommaire. De plus, taille rend hors portee l'etude systematique des composent. Il est donc necessaire limiter plus detaillee un nombre restreint d'individus, representatifs l'ensemble. C'est pourquoi nous avons cherche mesurer diversite existe entre souches. La technique utilisee RAPD (randomly amplified polymorphic DNA fingerprinting) permet une comparaison directe sequences d'ADN du genome Des regions amplifiees maniere aleatoire par PCR (DNA polymerase chain reaction), en utilisant amorces composees d'une sequence arbitraire dix nucleotides. Les bandes obtenues ensuite revelees electrophorese. similitudes profils traduisent similarites genome. Cette approche appliquee ensemble 78 lactobacilles et revele quatre groupes RAPD. G1 G3 renferment Lb pentosus tandis que G4 renferme plantarum. Neuf n'appartiennent pas groupes, pourraient representer types rares ou sous-representes dans collection. Cinquante-neuf presentent profil identique celui d'au moins autre souche. Parmi elles, 39 ont isolees simultanement meme produit probablement doublons. Enfin, parmi 18 dont le statut taxonomique etait incertain, 11 pu etre identifiees comme

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